Es el alma del Real Cortijo, un edificio sobrio y exento, situado en el frente de la Plaza Mayor y en el medio del Casco antiguo, se inauguró en el año 1788, diseñado por Manuel Serrano y terminado por Manuel Oliva; de estilo neoclásico con planta cuadrada de unos 225 m2, sus fachadas están fabricadas en ladrillo visto con zócalo de sillería de piedra caliza de Colmenar; la FACHADA PRINCIPAL tiene un frontón triangular que corona el frontispicio o balconada Real con barandilla, sobre 4 columnas redondas de estilo dorico, de piedra caliza.
En los laterales tiene dos torres campanarios gemelas, que albergan dos campanas de bronce.
El edificio está coronado por un tambor cilíndrico ciego, rematado por una cornisa corrida con una cubierta cónica revestida por teja curva, sobre la que se eleva una linterna cilíndrica dividida por 4 pilastras entre paños perforados por sendos óculos y cubierta por una media naranja emplomada que culmina en una gran bola con veleta y cruz de forja.
El interior
Al entrar se aprecia una capilla pequeña y coqueta, tiene planta de cruz griega. En el fondo está ubicado el altar elevado por 3 peldaños, entre 2 puertas simétricas que dan paso a las sacristías. En su parte posterior, frente del altar, hay un coro elevado.
Los ornamentos religiosos e imágenes se han ido consiguiendo por donativos y rifas de los feligreses, a destacar las 2 figuras de San Isidro, el Patrón, una de pasta de madera policromada y otra de madera, Virgen de Fátima, reloj carrillón, lámpara de techo con 16 brazos de bronce, etc.
Lo que impacta son 3 frescos de gran riqueza pictórica, realizados por el pintor, maestro Ramón Stolz Viciano, por el año 1950, de unos 4.50 m por 4.60 m, cada uno aproximadamente.
Representan temas alusivos a los milagros del Santo, con una perfecta composición, respetando la regla de oro de la pintura, variedad dentro de una unidad, de tonos suaves.
Dos de estos murales se encuentran en los paramentos laterales y el 3º sirve como retablo en el altar.
Textos: Josefina Freire Ferrero. Cronista Oficial del Real Sitio y Villa de Aranjuez con dedicación especial a la E.L.M. Real Cortijo de San Isidro